Negatif su yalıtımı yapı içerisinden suya geliş yönünden karşı yönde yapılan izolasyon işlemidir. Bu su yalıtım sisteminin yapı içerisinden değil binanın dışından yapılmasına pozitif yönden su yalıtımı denilmektedir. Negatif su yalıtımı yapılırken dikkat edilmesi gereken en önemli husus uygulamanın sadece toprak ile temas eden dış cephe duvarlarına yapılmasıdır. Kristalize su yalıtım uygulamasının ana teması perde duvar yüzeyinde yapılmasıdır. Yapılacak olan negatif su yalıtım sistemi için duvar yüzeyinde bulunan alçı, sıva, şap ve boya gibi katmanların alınması ve temizledikten sonra ana beton yüzeyine ulaşılması gerekir.
Negatif su yalıtım uygulamalarında çimento içeren sürme yalıtım materyalleri kullanılmaktadır. Yalıtım malzemeleri uygulamadan sonra beton içerisine nüfus eder. Beton içerisinde yer alan boşluklar kristal parçacıklar ile kapatılır. Kapatılan boşluklar sayesinde bina yüzeyine su girişi engellenmiş olur. Kristalize negatif su yalıtımı yapılırken dikkat edilmesi gereken noktalardan biri temel ve perde birleşim noktasında yer alan soğuk derz bölgesine ulaşmaktır. Bu bölge dışarından gelen suyun aktif olarak girebileceği en riskli bölgelerden biridir. Bundan dolayı bina boylu boyunca negatif su yalıtım uygulaması ile kaplanmalıdır.
Kristalize negatif su yalıtım uygulamasına takviye olarak bazı çalışmalar yapılmaktadır. Gerekli görülen yerlerde enjeksiyon uygulaması yapılarak soğuk derzlerde yer alan boşlukları kapatılır. Bu uygulama sayesinde bina yalıtımı daha kaliteli hale gelir ve uzun ömürlü olur.